Проектът стартира през 2001 г.: през 1999 г. контролът върху Панамския канал е прехвърлен от САЩ на панамските власти и в същото време възниква въпросът за новото използване на съседните територии. Една от секциите - по-рано заета от американската авиобаза - беше отредена за музей. Строителството започва през 2006 г., но едва в началото на октомври Biomuseo се отваря за обществеността - макар и все още не напълно: няколко зали и аквариум ще бъдат готови чак през зимата 2016 г.
Със своя пъстър алуминиев покрив музеят трябва да напомня за оживената природа на Панама, металните покриви на местните хижи и историческите структури на инфраструктурата на канала. Разположена на тесен полуостров, изпъкнал в залива, сградата се вижда отдалеч и сама може да предложи на своите посетители панорамна гледка към града и тихоокеанското „устие“на Панамския канал.
Продължителността на строителството на музея, наречен от местните жители „музеят, който никога няма да бъде завършен“, се обяснява, наред с други неща, с ниската квалификация на местните строители. Грубият бетон на подовете и стените трябваше да се излива многократно, а покривът с допустими отклонения от 6 мм също представляваше много трудности.
Сега обаче музеят е не само успешно изграден, но и почти изцяло изпълнен с изложбата „Мостът на живота“, която е проектирана от Брус Мау. Смитсоновият институт във Вашингтон отговаря за научната страна на проекта, а Biomuseo се превръща в единствения му музей-партньор извън САЩ.
Музеят е посветен на изумителното природно разнообразие на Панамския провлак: с площ от 75 000 км2, той е дом на повече видове птици, бозайници, влечуги и растения, отколкото в САЩ и Канада, взети заедно. Освен това изложението разказва подробно за процеса на формиране на провлака, започнал преди 12 милиона години и завършил преди 3 милиона години. Появата му промени екосистемите и климата в планетарен мащаб: вместо един океан възникнаха съвсем различни Атлантическия и Тихия океан, Гълфстрийм „тръгна“от нововъзникващото Карибско море и Северна и Южна Америка се обединиха за първи път от 70 милиона години. Активната миграция на животни започва по провлака и сравнително наскоро, преди 15 000 години, първите хора преминават този път от север на юг.
Biomuseo, който струва 95 милиона щатски долара (без да се броят разходите за все още незавършени изложбени зали), е предназначен предимно за ученици (планира се да се водят 40 000 студенти годишно там за безплатни екскурзии) и за туристи, тъй като терминалът на круизния кораб е много близо. В идеалния случай властите очакват „ефекта на Билбао“от музея. Според техния план тя трябва да се превърне в същия символ на Панама-град и Панама-държава, какъвто Операта на Утсън стана за Сидни и Австралия.
