Музеят, разположен на неудобен участък от 5-то авеню, от създаването си през 1929 г. до началото на този век, не може да се счита за популярна културна институция в Ню Йорк. Но благодарение на покровителството на сегашния кмет Майкъл Блумбърг и активната позиция на новото ръководство на института, ситуацията сега се промени драстично.
Една от най-важните стъпки към популяризирането на проблемите на „миналото, настоящето и бъдещето“на мегаполиса, на които е посветена дейността на музея, е преструктурирането на неговата сграда, структура от 1932 г. в неогрузинския стил. Джеймс Полезек издигна триетажен павилион от стъкло и алуминий зад него, обнови откритите пространства около сградата; фоайето и залата на ротондата на старата сграда бяха реконструирани и свързани с новия павилион; реставрирана е основната фасада.
Стъкленият куб на новото крило съдържа два етажа от галерия с временни изложби и подземен "център за съхранение" със складови помещения (по-специално за 500 000 фотографска колекция на музея) и помещения за реставрационни дейности.
Архитектурното обновяване е съчетано с нова, публично ориентирана изложбена програма. Наскоро музеят показа временна изложба, посветена на Робърт Моузес, урбанистът, който до голяма степен оформи лицето на съвременния Ню Йорк със своите мащабни проекти от 1930-1950-те; поради противоречивата оценка на дейностите на главния герой, изложбата получи широк отзвук в пресата и вълна от интерес на посетителите.
Сега в залите на музея можете да видите експозиции на актуални теми: „Президентската кампания: Ню Йорк и американските избори“, „Католици в Ню Йорк. 1808-1946 "," Ню Йорк - Бързо напред: Нийл Денари гради на високата линия "(последният е посветен на небостъргача, който се строи сега).
Реставрацията на старите изложбени зали обаче все още предстои на музея, която трябва да приключи до 2011 година.