През 1966 г. Уцон е отстранен от проекта си поради финансови разногласия, които е имал с австралийските власти. Архитектите, които продължиха строежа на театъра, преместиха оперната зала вътре в сградата, а също така добавиха към проекта още няколко аудитории, които първоначално бяха непланирани.
В резултат на това основната зала на оперния театър има посредствени акустични качества поради недостатъчния си размер, някои музиканти от неговия оркестър трябва да седят на дълбочина 12 м в сравнение със сцената, а балерините, напускащи сцената, трябва да бъдат застраховани така че не удрят бетонните стени: за да могат да се спрат, просто не.
Сега Utzon предлага да се понижи нивото на пода на залата с 4 метра, като се използва пространството на административно-техническите помещения под нея, а за тях от своя страна се изрязват нови отделения в скалистата основа от пясъчник, върху която стои театърът. Това ще подобри звука на музиката, а зад сцената ще има повече свободно пространство.
Самият Йорн Уцон няма да може да дойде от Дания в Сидни: на 88-годишна възраст ще му бъде твърде трудно. Ако властите одобрят проекта, неговият син Иън ще наблюдава изпълнението на проекта.
