Новата сграда на стойност 79 милиона евро се намира между градската гара, главната търговска улица Porschestraße и заводския комплекс на Volkswagen. Наблизо има железопътни коловози и корабен канал. Такава среда за бъдещо строителство би трябвало да изплаши архитекта, но Хадид успешно влезе в музея си в индустриалния пейзаж.
Сградата е издигната над земята върху десет двойни стълба, които приличат на обърнати конуси. В тях се помещава музейна книжарница, аудитория с 250 места, конферентна зала и вход за музея.
По този начин по-голямата част от сградата е заета от едно изложбено пространство; няма ясно разделение между отделни области на знанието, представени под формата на различни инсталации. Повечето от тях могат да бъдат стартирани от всеки посетител; по този начин организаторите на музея се надяват, чрез прякото участие на публиката, да направят законите на физиката, химичните свойства на веществата и основите на биологията по-разбираеми за тях.
В тази изложбена зона няма предписан ред за проверка и благодарение на особеностите на архитектурата на Хадид дори човек, който си представя архитектурен проект и неговия план, губи ориентация там след няколко минути. Таваните или се спускат отдолу, или образуват просторни зали; подът се издига и пада; стените се приближават една към друга и се разделят отново. Но това се представя от клиентите като достойнство на сградата: спонтанността и естествеността на прехода от един експонат към друг, от една тема към друга, трябва да допринесе за „смилаемостта“на получената информация. Заха Хадид описва интериора на музея като поредица от експлодиращи частици.
Особено внимание беше обърнато и на дизайна на обекта около музея. Там е създаден своеобразен градски площад, връзка между гарата и завода на Volkswagen, където освен производствените мощности се намира и търговско-развлекателният комплекс Autostadt. Посетителите трябва да преминат под сградата на музея, по пътеката, обозначена с яркосиня линия, павирана върху асфалта.
